Догляд за джунгарським хом'яком включає забезпечення просторої клітки площею не менше 2500 см² з кількома рівнями. Клітка повинна містити колесо для бігу діаметром не менше 20 см, будиночок для сну, іграшки для гризіння та тунелі для дослідження. Підстилку необхідно міняти раз на тиждень, а кути клітки, де хом'як ходить у туалет - частіше. Важливо підтримувати оптимальну температуру 18-22°C, оскільки ці тварини чутливі до перегріву. Клітку слід розташовувати подалі від прямих сонячних променів та протягів. Необхідно щодня прибирати залишки їжі та перевіряти чистоту води. Важливою частиною догляду є забезпечення матеріалів для стачування зубів, які постійно ростуть. Соціалізацію слід проводити регулярно, але обережно, особливо вдень, коли хом'яки зазвичай сплять. Також важливо регулярно перевіряти стан кігтів та зубів тварини.

Раціон джунгарського хом'яка повинен бути різноманітним та збалансованим. Основу харчування складає спеціальний корм для хом'яків, який містить суміш зерен, насіння та сушених овочів. Це забезпечує необхідні поживні речовини та допомагає стачувати зуби. Додатково можна давати свіжі овочі та фрукти в невеликих кількостях (близько 10% від загального раціону): моркву, броколі, яблука (без насіння), огірки. Білкову їжу слід давати 2-3 рази на тиждень у вигляді вареного курячого м'яса без спецій, варених яєць або спеціальних білкових добавок для гризунів. Важливо забезпечити постійний доступ до свіжої води через поїлку. Солодощі та людську їжу давати категорично заборонено. Годувати хом'яка краще ввечері, коли він найбільш активний. Порції повинні бути невеликими, оскільки хом'яки схильні до накопичення їжі в щоках та схованках.

Джунгарські хом'яки можуть страждати від діабету, тому важливо обмежувати солодку їжу. Поширені проблеми включають респіраторні інфекції, що виникають через протяги або вологість, та проблеми із зубами через неправильне харчування. Можуть виникати шкірні захворювання, особливо при поганій гігієні клітки. Тривалість життя становить 1.5-2 роки. Важливо регулярно спостерігати за поведінкою, апетитом та зовнішнім виглядом хом'яка для раннього виявлення можливих проблем зі здоров'ям.