Догляд за Сіба Іну вимагає регулярної але не надто складної уваги. Їхня подвійна шерсть потребує щотижневого вичісування, а в періоди линьки (двічі на рік) - щоденного догляду спеціальною щіткою. Купати собаку потрібно лише за необхідності, оскільки їхня шерсть має природні водовідштовхувальні властивості та здатність до самоочищення. Важливим аспектом догляду є забезпечення достатньої фізичної активності - щоденні прогулянки тривалістю не менше години та можливість вільного бігу на огородженій території. При цьому важливо пам'ятати про сильний мисливський інстинкт породи і тримати собаку на повідку в незнайомих місцях. Необхідно регулярно перевіряти та чистити вуха, зуби та очі, підстригати кігті кожні 3-4 тижні. Особливу увагу слід приділяти безпеці подвір'я, оскільки Сіба Іну відомі своєю здатністю до втечі та можуть перестрибувати навіть високі паркани.

Харчування Сіба Іну повинно бути збалансованим та відповідати їхній активності та розміру. Рекомендується використовувати якісний сухий корм преміум-класу, спеціально розроблений для собак середніх порід з високою активністю. При натуральному годуванні раціон повинен складатися з нежирного м'яса (45-50% раціону), круп (25-30%), овочів (15-20%) та кисломолочних продуктів (5-10%). Важливо включати в раціон омега-3 та омега-6 жирні кислоти для підтримки здоров'я шкіри та шерсті. Сіба Іну схильні до ожиріння, тому важливо контролювати порції та не перегодовувати собаку. Дорослих собак рекомендується годувати двічі на день, дотримуючись регулярного графіку. Цуценята потребують більш частого годування - 3-4 рази на день. Важливо забезпечити постійний доступ до свіжої води та уникати годування зі столу людською їжею.

Сіба Іну відносно здорова порода, але може мати схильність до певних генетичних захворювань. Найпоширенішими проблемами є дисплазія кульшових суглобів, патела (вивих колінної чашечки), очні захворювання (катаракта, прогресуюча атрофія сітківки), алергії та проблеми зі щитовидною залозою. Також може зустрічатися глаукома та хвороба фон Віллебранда (порушення згортання крові). Важливо проводити регулярні профілактичні огляди у ветеринара та своєчасно робити всі необхідні щеплення.